PCR仪的PCR即聚合酶链式反应，是指在DNA聚合酶催化下，以母链DNA为模板，以特定引物为延伸起点，通过变性、退火、延伸等步骤，体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程。是一项DNA体外合成放大技术，能快速特异地在体外扩增任何目的DNA。可用于基因分离克隆，序列分析，基因表达调控，基因多态性研究等许多方面。
梯度温度控制是帮助用户进行PCR优化实验的特性之一，以便确定PCR实验方案的佳温度和保持时间，尽量减少实验次数。在理论上，真正的梯度应在均匀的金属加热模块上显示线性温度斜率。
然而，传统梯度PCR仪通常只采用单一的热模块并通过位于两端的两个加热及冷却元件进行温度的控制。该设计经常会导致以下限制：
1.仅能设置两个温度：在热模块的两端设置引物退火的高、低极限温度。因此，无法在模块间实现其他区域温度的准确设置。
2.由于不同列之间的热学相互作用，模块上不同区域之间的温度更可能遵循的是S形的曲线变化而非真正的线性梯度。
新型梯度PCR仪可实现更好的引物退火温度控制。该技术的一种形式便是设计带有三个或更多分割金属模块的PCR仪，每一模块都具有独立的加热和冷却元件。选择能够准确进行梯度温度控制的PCR仪将大大节省优化所需时间，找到佳的退火温度和时间，并确保在梯度模式下优化的条件在正常模式下也能获得相同的结果。
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